W ramach współpracy dwustronnej Narodowe Centrum Badań i Rozwoju współdziała z instytucjami zagranicznymi, głównie spoza Unii Europejskiej, oferując w ramach nawiązanej współpracy uczestnictwo w projektach o różnorodnej tematyce. Wymagania konkursowe zwykle wynikają z zasad, jakie wypracowane zostały z zagranicznym partnerem.
Wśród oferty NCBiR są m.in. kraje, z którymi można nawiązać współpracę w odpowiedzi na ogłaszane konkury: Chiny, Izrael, Japonia, Luksemburg, Niemcy, RPA, Singapur, Tajwan, Turcja, Norwegia, Korea. NCBiR przygotowuje się do nawiązania współpracy lub rozwija współpracę z Brazylią i Jordanią, co w przyszłości zaowocować może nowymi konkursami.
Szczegółowe informacje można znaleźć na stronach Narodowego Centrum Badań i Rozwoju:
http://www.ncbr.gov.pl/programy-miedzynarodowe/wspolpraca-dwustronna/